SnapGene 6是一款专业又好用的分子生物学工具。能够帮助大家在进行生物分析的时候提供很大的帮助,特别是在对DNA进行操作的时候可以帮助使用者将DNA进行可视化和模拟,若是在操作过程之中出现错误的话还会提醒用户,而且所有的操作也是会进行记录,需要的时候在电脑之中就可以找到,相当的实用。现在各行业的人士越来越多,所使用的各种工具都是有所不同,设计师需要一款专业的设计软件,而对于生物学的学生或者是此类专业人士来说一款专业的软件是必不可少的,这不仅可以带来更高的工作效率,还可以在时间上减少,这款软件就拥有相当专业的DNA分析序列分析能力,多种设定都可以进行自定义设置,其中包括了特征、DNA颜色、引物等等,其中最为强大的就是该软件拥有高效的数据处理能力,可以对大型DNA序列进行扫描,另外还拥有插入、替换、删除等功能。除此之外该软件用于计划、可视化、记录等方面都拥有绝对的优势,操作方式更加的简单,时间也会随之减少,而且若是对功能和设计参数进行注释的话也会变得更加的容易,同时还拥有详细的技术工作原理,不管是学习上还是工作中都可以获得更加便捷的操作。小编本次带来的是SnapGene 6中文破解版,内置破解文件,下方还有小编给大家准备好的完整安装教程(附破解教程),大家快来下载试试吧。
安装教程(附破解教程)
1.在吾爱破解吧下载压缩包后进行解压得到以下文件;2.双击exe程序进入安装向导;
3.默认是C盘,点击Browse可更改安装路径,点击Next;
4.点击I Agree;
5.选择需要的组件,点击Next;
6.点击Install开始安装;
7.安装之中,等待片刻;
8.点击Finish退出安装向导;
9.将破解文件复制到软件根目录下方并替换即可完成破解。
功能介绍
1.In-Fusion 克隆Clontech 的 In-Fusion 克隆技术是创建无缝基因融合的一种非常通用的方法。是第一个模拟此程序的软件。 只需选择您想要融合的 DNA 片段,即可设计引物。
2.Gibson Assembly
许多研究人员转向 Gibson 组装,在不使用限制性酶的情况下将片段插入质粒中。待连接的 DNA 片段通过 PCR 扩增以产生重叠的末端。简化了Gibson组装反应的计划,并自动化了引物设计。
3.限制性克隆
SnapGene 6独特的限制克隆界面以干净的布局显示您需要的信息。克隆程序的规划从来没有这么简单过。如果你已经知道你想做什么,克隆模拟只需要几秒钟。如果克隆过程存在设计缺陷,则可以在模拟过程中捕获并纠正错误。
4.聚合酶链反应与诱变
设计引物后,它们可以用来模拟常规 PCR、重叠延伸 PCR 或诱变。得到的DNA序列文件可立即用于进一步操作。与限制克隆界面一样,以引物为中心的界面以直观的方式显示关键信息。
5.自动保存
最令人惊讶的是它自动记录了克隆项目中的步骤。每次编辑序列或模拟克隆、PCR 或诱变时,程序都会自动记录在图形历史中。在模拟 DNA 构建体的创建之后,您可以使用历史作为实验方案。
6.琼脂糖凝胶电泳
napGene 使用一种先进的算法来创建真实的琼脂糖凝胶模拟。限制性片段以三种形式显示:模拟凝胶、数值列表和序列图。您可以使用模拟凝胶计划诊断限制摘要,或将实际凝胶图像与预测模式进行比较。
7.酶位点
以清晰的方式突出限制位点,自动标记甲基化阻断的位点。简单的控制可以让你选择有用的酶组,比如“独特的切割器”,或者定义自定义酶组和首选供应商。信息工具提示提供关键数据。“限制酶”窗口显示了数百种商用酶的详细特性。
支持功能
1.设计更好的流程准确地设计和模拟克隆过程。测试复杂方案、预防潜在错误,第一次就可获得正确构造。
提高准确性,同时加快进程,节约你的时间和金钱。
优雅、信息丰富的窗口,以模拟常见克隆和PCR方法
清晰的示意图,让你清楚地看到不同构造如何组合在一起
通过持续跟踪DNA甲基化和磷酸化等细节,助你识别并规避常见失误
2.可视化你的流程
当你能看到你在做什么时,克隆会更加容易。直观的界面为你的工作提供了无与伦比的可视性,简化了通常较复杂的任务。
凭借无与伦比的可视性和操控性,即使是克隆新手也能快速应对复杂任务。
获得非凡的DNA及蛋白质序列的可视结果
创建和浏览带有丰富注释的质粒图,或扫描带有数千个注释特性的大型DNA序列
通过高度可视化的测序结果与模拟结构的比对,以确认克隆结果
3.自动记录你的工作
自动化归档,让你无需为文档管理担忧。查看和分享每一个序列编辑和克隆程序,直至找到你的最终质粒。
模拟程序的自动化归档,助你节省更多时间,并让分享和保存工作更轻松、更高效、也更有效。
自动生成丰富的图形历史记录,轻松查看序列编辑和克隆程序
通过共享包含历史细节的完整结构,以增强协作、留存知识点
大胆尝试全面的“撤销”功能,追溯你的每一步
功能优点
1.琼脂糖凝胶电泳使用先进的算法来创建逼真的琼脂糖凝胶模拟。限制片段以三种格式显示:模拟凝胶,数字列表和序列图。您可以使用模拟凝胶计划诊断性限制消化,或将实际凝胶图像与预测模式进行比较。
2.DNA序列中的注释功能非常简单。
格式与GenBank标准相匹配,但添加了诸如颜色,方向性和片段等选项。编码序列被翻译,以便您可以可视化密码子,追踪氨基酸编号,并检查阅读框架以寻找基因融合。功能可以从其他文件导入,或者从可定制列表中自动注释。
3.引物的设计和可视化
与许多其他程序不同,使用严格的热力学算法来计算解链温度和双链路线。您可以使用引物模拟程序,如PCR,诱变和In-Fusion克隆。引物可以从其他文件导入或导出为文本格式。
4.大序列
在这个基因组时代,你的分子生物学软件应该能够处理染色体大小的序列。由于采用了专有的MICA算法,可以用于浏览具有数千个注释功能的大型序列。智能搜索和缩放控制使得染色体的导航非常简单。
5.多功能数据导入和导出
可以读取许多常见的文件格式,捕获DNA序列和注释。支持的格式列表包括 APE, DNASTAR的Lasergene, 基因工程Kit, 基因库, MacVector, 矢量NTI等等。
功能优点
一、想象1.DNA可视化
查看DNA序列的多个视图。
地图 · 序列 · 酶 · 特征 · 引物 · 历史
自定义酶位点,特征,引物,ORF,DNA颜色等的显示。地图可以是圆形或线性格式。
使用双链模式查看酶位点,具有翻译,引物和DNA颜色的特征。单链模式显示具有彩色特征的紧凑概览。
从一系列酶组中选择。剪切网站可以显示为数字或行,按名称或频率排序。
按名称,位置,大小,颜色,方向性或类型对带注释的要素列表进行排序。复选框在紧凑或完全展开的显示之间切换。
按名称,长度,颜色,结合位点,方向性或解链温度对杂交引物列表进行排序。复选框在紧凑或完全展开的显示之间切换。
查看DNA构建体的自动生成的图形历史记录。祖先序列可以作为单独的文件恢复
2.大序列支持
浏览染色体大小序列。
查看 · 搜索 · 缩放
利用高效数据处理功能,扫描具有数千种注释功能的大型DNA序列。
使用专有的MICA算法立即在染色体内找到序列。
使用多功能控件调整缩放系数和显示区域。
3.蛋白质可视化
查看蛋白质序列的多个视图。
地图 · 序列 · 属性 · 特征 · 历史
自定义区域,站点,键和序列颜色的显示。
使用具有相关特征的1-或3个字母的氨基酸代码查看蛋白质序列。
查看蛋白质的分子量,消光系数,等电点和氨基酸组成。可以对蛋白质的选定部分进行相同的分析。
按名称,位置,大小,颜色或类型对带注释的功能列表进行排序。复选框在紧凑或完全展开的显示之间切换。
查看自动生成的蛋白质序列图形历史记录。祖先蛋白质或DNA序列可以作为单独的文件再生。
4.直观的序列编辑
轻松编辑DNA和蛋白质序列。
标准编辑 · DNA结束
进行插入,删除,替换和大小写更改。复制并粘贴序列时,会自动传输功能。
编辑线性DNA序列的末端以添加或去除突出端或磷酸酯。
5.序列颜色编码
将选定的DNA或氨基酸序列设置为十种颜色之一。
给两条DNA链或蛋白质序列着色。颜色在Map和Sequence视图中都可见。
6.特征注释
自动注释常用功能,或手动注释新增功能。
自动特征检测 · 手动特征注释
使用该软件广泛的数据库查找DNA序列中的常见特征。您选择的其他功能可以添加到自定义数据库中。
选择DNA或蛋白质序列的一部分,并使用灵活的GenBank兼容控件注释特征。
二、模拟
1.限制性站点指标
确认限制性网站适合克隆。
独特性 · 甲基化敏感性 · 特殊性质
以粗体显示独特的限制性位点,或选择自动定义的Unique Cutters或Unique 6+ Cutters酶组。
不要被愚弄,因为限制性位点被Dam,Dcm或EcoKI甲基化阻断。该软件将自动用星号标记该站点。
利用工具提示来避免有问题的限制网站。
2.限制性克隆
可视化克隆过程的所有方面。
如果您已经考虑过程,则模拟只需几秒钟。如果克隆过程存在设计缺陷,则可以捕获并纠正错误。
3.PCR
模拟标准PCR。
使用您自己的引物,或要求动设计引物。产品文件在其历史记录中存储模板和引物。
4.重叠延伸PCR
通过重叠延伸PCR融合片段
最多可组装八个碎片。选择要连接的片段及其方向,该软件将设计引物。
5.引物定向诱变
使用诱变引物进行定点诱变。
选择诱变引物,按下按钮查看修饰的质粒。历史颜色突出了突变。
6.网关®克隆
模拟网关® BP克隆或LR克隆,或两者在同一时间。
为方便起见,提供了常见的供体向量和目的向量。选择要组装的片段,该软件将设计引物。
7.吉布森大会®
通过融合多达八个片段或通过将多达八个片段插入向量来模拟Gibson Assembly。Gibson Assembly是一种流行的无缝克隆方法。
选择要融合的片段及其方向,该软件将设计引物。线性化的载体可以通过酶消化或反向PCR产生。
8.IN-FUSION ®克隆
通过在向量中插入最多八个片段来模拟Clontech的In-Fusion克隆。In-Fusion克隆是一种非常通用的方法,可用于创建无缝基因融合。
选择要融合的片段及其方向,该软件将设计引物。线性化的载体可以通过酶消化或反向PCR产生。
9.TA和GC克隆
通过TA或GC克隆捕获PCR产物。
选择传统的TA克隆或高效GC克隆。
为方便起见,提供了常见的TA克隆载体和Lucigen的GC克隆载体。
10.退火Oligos
退火两个寡核苷酸形成双链产物。
使用简单的控件添加突出限制克隆。
三、避免错误
使用SnapGene 6,确保构造符合您的要求,并确认您获得了所需的序列。
1.阅读基因融合的框架
确保构造中的已转换要素符合框架。
链接翻译 · 警告信息
使用“序列”视图可以快速查看两个已翻译的要素是否在框架中。如果是这样,翻译链接在同一行。如果不是,则翻译在单独的行上。
2.与参考序列对齐
使用强大的对齐工具检查实际构造是否与模拟构造匹配。
地图概述 · 序列详细信息
请参阅对齐序列与参考序列匹配的位置的概述,以及存在差异的位置。
四、自动录制
该软件自动记录操作以创建图形历史记录,并将祖先结构存储在最终文件中。
1.全面的“撤销”能力
几乎撤消任何操作。
不要害怕尝试使用文件 - 回溯您的步骤很容易。
2.历史和嵌入式祖先
查看构造的图形历史记录。
单击操作以突出显示亲本和产物序列的相关部分,或单击PCR引物名称以查看引物序列。
单击历史记录树中的祖先以重新生成该祖先序列文件,包括其注释和克隆历史记录。
3.历史色彩
使用可选的历史记录颜色来标识序列的最新更改。
详细了解构建体的组装方式,包括结扎的粘性末端。
五、拥有你的数据
该软件允许您根据需要阅读和共享文件,同时保持对数据的完全控制。
1.安全文件管理
将该软件文件保存在所需的位置。
使用熟悉的安全操作系统来存储和整理该软件文件。
2.从其他格式导入
阅读许多常见的文件格式。
不仅可以导入DNA序列,还可以导入注释和注释。我们将继续开发进口商,以确保您不会被锁定为专有文件格式。
3.导出为标准格式
将序列,地图或凝胶图像转换为标准格式,以便与其他软件一起使用。
将序列导出为GenBank或FASTA格式。将地图或模拟琼脂糖凝胶导出为常见的图像格式。
4.使用Viewer共享数据
将该软件格式的文件发送给可以下载免费该软件的同事或客户。
只需将文件与链接一起发送到该软件即可。收件人将能够看到地图,序列和注释,就像在完整界面中一样。
5.对于开发人员
要将该软件整合到您的数据分析或实验室管理软件中,请联系我们以获取有关如何读取和写入该软件文件的信息。
六、转换文件格式
开放式信息交换至关重要,因此该软件和该软件提供了读取和导出常见文件格式的选项。
从其他格式导入时,目标不仅是捕获DNA序列,还捕获注释和注释
新增功能介绍
1.重叠群大会线性或环状重叠群可以从重叠序列或Sanger序列迹线重新组装。
2.灵活的对齐
现在可以以各种方式导入要对齐的序列。可以提取多个对齐的一部分以生成新的多重对齐,或者可以编辑现有的多个对齐以添加或移除由不同算法生成的对齐。
3.Nicking Enzymes
可以显示Nicking核酸内切酶。当选择跨越从线性序列的末端到切口核酸内切酶位点时,可以通过按Delete删除该单链区域。
4.点特征
现在,DNA序列支持零长度点功能,并在从GenBank,MacVector或Gene Construction Kit导入文件时识别。
5.酶网站突出显示
常用的酶位点可以用黄金突出显示,以便快速识别。
6.协调一致性增强
多重比对的共识序列具有改进的格式,现在可以复制或导出。
7.用于与参考序列对齐的存储编辑
根据流行的需求,当通过调整比对序列的端点编辑与参考DNA序列的比对时,保留和恢复那些编辑。
8.从其他文件格式导入功能
可以将特征导入到BED,GFF3或GTF格式的DNA序列中。
9.从UniProt导入
可以从UniProt数据库导入蛋白质序列记录。
10.进口基因组编译器项目
现在可以在SnapGene 6中直接打开Genome Compiler项目文件(.gcproj)。对于施工项目文件,在“历史记录”视图中捕获施工历史。
11.引物添加日期
将引物添加到文件时,会记录日期。引物可按添加日期排序。
12.读取和写入对齐文件格式
该软件可以将对齐导入SAM / BAM和VectorNTI®.cep格式的参考序列,并可以将对齐导出为SAM / BAM格式的参考序列。
网友 Wkey007 评论:
使用感受:有了它的帮助,我在日常的工作上无论是效率还是质量上面都得到了很大的提升,我想要的功能,这款软件都已经尽量满足了我,这点让我很是开心,如果你想要一款功能强大且又好用的工具,那么它也许会适合你
SnapGene 6历史版本下载
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