SnapGene是一款分子研究类电脑软件,是专业领域上的研究办公软件,这款软件可以帮助研究人员分析研究分子DNA的序列,该软件可以将DNA进行一个可视化的模拟,并且将错误的操作第一时间提醒用户,在这款软件内做的一切操作都将会在后台进行记录,确保用户后期的回放与学习!
SnapGene破解版软件内还为用户提供了十分详细的技术工作原理,可以帮助用户在该软件中的学习,也确保了用户在软件中可以更加智能化的操作,软件软还适用于实验室的管理,可以说是是分子研究人员的一个不错的管理研究平台!
软件特点
1.为学生,博士后和技术人员带来的好处
工作更快,更聪明
SnapGene 使您的 DNA 操作易于可视化和模拟,并在错误发生之前提醒您。
保持记录不费吹灰之力
SnapGene 中的每个 DNA 操作都会自动记录,因此您可以准确地看到您所做的操作并检索祖先结构的序列。
随时随地学习
如果您不熟悉克隆或特定技术,丰富直观的 SnapGene 界面可帮助您了解其工作原理。
轻松与世界各地的同事共享数据
SnapGene 的 .dna 文件可以通过免费的跨平台 SnapGene Viewer 打开,使您能够与同事共享丰富的带注释的地图和序列。
2.PI 和实验室管理器的好处
更快地获得结果
实验室中的人员将不再使用有缺陷的克隆程序浪费时间,并将在第一时间开始获得正确的构造。
花更少的时间教人们如何克隆
SnapGene 是一个很好的教学工具,甚至新手克隆人也会很快学会如何自己解决问题。
存钱
即使是有经验的科学家也会犯错 通常,至少 10% 的程序由于计划错误而失败,从而导致浪费时间和材料。使用 SnapGene 可以防止这些损失,SnapGene 将多次收回成本。
保持更好的实验室记录
SnapGene 自动生成每个序列编辑和克隆过程的记录,因此即使在实验室成员离开后,您也不会忘记构造的构建方式。
3.IT 部门的好处
您可以在整个站点范围内实施我们灵活的许可选项,也可以从小规模开始实施,并以可访问的价格增长。
4.对行业的好处
操作快点
借助 SnapGene 直观的用户体验,强大的可视化和仿真工具以及错误预防功能,您公司的研发工作将更快地进行。
保持记录不费吹灰之力
SnapGene 自动生成每个序列编辑和克隆过程的丰富图形历史记录,因此您永远不会忘记构造的构建方式。
获得您现在和将来所需的功能
SnapGene 正在积极开发中,由工作科学家设计。我们不断发布新增功能和增强功能,并根据客户反馈确定优先级。
拥有您的数据并保护您的 IP
SnapGene 不会将您锁定到特定的文件格式或数据存储位置,因此您始终可以控制数据。桌面许可方法可确保您的数据在公司防火墙和公司硬件之后的安全。
无缝实施
SnapGene 支持大量文件格式。因此,您的科学家可以完全切换到 SnapGene 而不会丢失数据,或者可以继续使用遗留软件和 SnapGene 而不会发生冲突。
支持功能介绍
一、想象
1.DNA可视化
查看DNA序列的多个视图。
地图 · 序列 · 酶 · 特征 · 引物 · 历史
自定义酶位点,特征,引物,ORF,DNA颜色等的显示。地图可以是圆形或线性格式。
使用双链模式查看酶位点,具有翻译,引物和DNA颜色的特征。单链模式显示具有彩色特征的紧凑概览。
从一系列酶组中选择。剪切网站可以显示为数字或行,按名称或频率排序。
按名称,位置,大小,颜色,方向性或类型对带注释的要素列表进行排序。复选框在紧凑或完全展开的显示之间切换。
按名称,长度,颜色,结合位点,方向性或解链温度对杂交引物列表进行排序。复选框在紧凑或完全展开的显示之间切换。
查看DNA构建体的自动生成的图形历史记录。祖先序列可以作为单独的文件恢复
2.大序列支持
浏览染色体大小序列。
查看 · 搜索 · 缩放
利用SnapGene的高效数据处理功能,扫描具有数千种注释功能的大型DNA序列。
使用专有的MICA算法立即在染色体内找到序列。
使用多功能控件调整缩放系数和显示区域。
3.蛋白质可视化
查看蛋白质序列的多个视图。
地图 · 序列 · 属性 · 特征 · 历史
自定义区域,站点,键和序列颜色的显示。
使用具有相关特征的1-或3个字母的氨基酸代码查看蛋白质序列。
查看蛋白质的分子量,消光系数,等电点和氨基酸组成。可以对蛋白质的选定部分进行相同的分析。
按名称,位置,大小,颜色或类型对带注释的功能列表进行排序。复选框在紧凑或完全展开的显示之间切换。
查看自动生成的蛋白质序列图形历史记录。祖先蛋白质或DNA序列可以作为单独的文件再生。
4.直观的序列编辑
轻松编辑DNA和蛋白质序列。
标准编辑 · DNA结束
进行插入,删除,替换和大小写更改。复制并粘贴序列时,会自动传输功能。
编辑线性DNA序列的末端以添加或去除突出端或磷酸酯。
5.序列颜色编码
将选定的DNA或氨基酸序列设置为十种颜色之一。
给两条DNA链或蛋白质序列着色。颜色在Map和Sequence视图中都可见。
6.特征注释
自动注释常用功能,或手动注释新增功能。
自动特征检测 · 手动特征注释
使用SnapGene广泛的数据库查找DNA序列中的常见特征。您选择的其他功能可以添加到自定义数据库中。
选择DNA或蛋白质序列的一部分,并使用灵活的GenBank兼容控件注释特征。
二、模拟
1.限制性站点指标
确认限制性网站适合克隆。
独特性 · 甲基化敏感性 · 特殊性质
以粗体显示独特的限制性位点,或选择自动定义的Unique Cutters或Unique 6+ Cutters酶组。
不要被愚弄,因为限制性位点被Dam,Dcm或EcoKI甲基化阻断。SnapGene将自动用星号标记该站点。
利用工具提示来避免有问题的限制网站。
2.限制性克隆
可视化克隆过程的所有方面。
如果您已经考虑过程,则模拟只需几秒钟。如果克隆过程存在设计缺陷,则可以捕获并纠正错误。
3.PCR
模拟标准PCR。
使用您自己的引物,或要求SnapGene自动设计引物。产品文件在其历史记录中存储模板和引物。
4.重叠延伸PCR
通过重叠延伸PCR融合片段
最多可组装八个碎片。选择要连接的片段及其方向,SnapGene将设计引物。
5.引物定向诱变
使用诱变引物进行定点诱变。
选择诱变引物,按下按钮查看修饰的质粒。历史颜色突出了突变。
6.网关?克隆
模拟网关? BP克隆或LR克隆,或两者在同一时间。
为方便起见,提供了常见的供体向量和目的向量。选择要组装的片段,SnapGene将设计引物。
7.吉布森大会?
通过融合多达八个片段或通过将多达八个片段插入向量来模拟Gibson Assembly。Gibson Assembly是一种流行的无缝克隆方法。
选择要融合的片段及其方向,SnapGene将设计引物。线性化的载体可以通过酶消化或反向PCR产生。
8.IN-FUSION ?克隆
通过在向量中插入最多八个片段来模拟Clontech的In-Fusion克隆。In-Fusion克隆是一种非常通用的方法,可用于创建无缝基因融合。
选择要融合的片段及其方向,SnapGene将设计引物。线性化的载体可以通过酶消化或反向PCR产生。
9.TA和GC克隆
通过TA或GC克隆捕获PCR产物。
选择传统的TA克隆或高效GC克隆。
为方便起见,提供了常见的TA克隆载体和Lucigen的GC克隆载体。
10.退火Oligos
退火两个寡核苷酸形成双链产物。
使用简单的控件添加突出限制克隆。
三、避免错误
使用SnapGene,确保构造符合您的要求,并确认您获得了所需的序列。
1.阅读基因融合的框架
确保构造中的已转换要素符合框架。
链接翻译 · 警告信息
使用“序列”视图可以快速查看两个已翻译的要素是否在框架中。如果是这样,翻译链接在同一行。如果不是,则翻译在单独的行上。
2.与参考序列对齐
使用强大的对齐工具检查实际构造是否与模拟构造匹配。
地图概述 · 序列详细信息
请参阅对齐序列与参考序列匹配的位置的概述,以及存在差异的位置。
四、自动录制
SnapGene自动记录操作以创建图形历史记录,并将祖先结构存储在最终文件中。
1.全面的“撤销”能力
几乎撤消任何操作。
不要害怕尝试使用SnapGene文件 - 回溯您的步骤很容易。
2.历史和嵌入式祖先
查看构造的图形历史记录。
单击操作以突出显示亲本和产物序列的相关部分,或单击PCR引物名称以查看引物序列。
单击历史记录树中的祖先以重新生成该祖先序列文件,包括其注释和克隆历史记录。
3.历史色彩
使用可选的历史记录颜色来标识序列的最新更改。
详细了解构建体的组装方式,包括结扎的粘性末端。
五、拥有你的数据
SnapGene允许您根据需要阅读和共享文件,同时保持对数据的完全控制。
1.安全文件管理
将SnapGene文件保存在所需的位置。
使用熟悉的安全操作系统来存储和整理SnapGene文件。
2.从其他格式导入
阅读许多常见的文件格式。
不仅可以导入DNA序列,还可以导入注释和注释。我们将继续开发进口商,以确保您不会被锁定为专有文件格式。
3.导出为标准格式
将序列,地图或凝胶图像转换为标准格式,以便与其他软件一起使用。
将序列导出为GenBank或FASTA格式。将地图或模拟琼脂糖凝胶导出为常见的图像格式。
4.使用SnapGene Viewer共享数据
将SnapGene格式的文件发送给可以下载免费SnapGene Viewer的同事或客户。
只需将文件与链接一起发送到SnapGene Viewer即可。收件人将能够看到地图,序列和注释,就像在完整的SnapGene界面中一样。
5.对于开发人员
要将SnapGene整合到您的数据分析或实验室管理软件中,请联系我们以获取有关如何读取和写入SnapGene文件的信息。
六、转换文件格式
开放式信息交换至关重要,因此SnapGene和SnapGene Viewer提供了读取和导出常见文件格式的选项。
从其他格式导入时,目标不仅是捕获DNA序列,还捕获注释和注释
新增功能介绍
1.重叠群大会
线性或环状重叠群可以从重叠序列或Sanger序列迹线重新组装。
2.灵活的对齐
现在可以以各种方式导入要对齐的序列。可以提取多个对齐的一部分以生成新的多重对齐,或者可以编辑现有的多个对齐以添加或移除由不同算法生成的对齐。
3.Nicking Enzymes
可以显示Nicking核酸内切酶。当选择跨越从线性序列的末端到切口核酸内切酶位点时,可以通过按Delete删除该单链区域。
4.点特征
现在,DNA序列支持零长度点功能,并在从GenBank,MacVector或Gene Construction Kit导入文件时识别。
5.酶网站突出显示
常用的酶位点可以用黄金突出显示,以便快速识别。
6.协调一致性增强
多重比对的共识序列具有改进的格式,现在可以复制或导出。
7.用于与参考序列对齐的存储编辑
根据流行的需求,当通过调整比对序列的端点编辑与参考DNA序列的比对时,保留和恢复那些编辑。
8.从其他文件格式导入功能
可以将特征导入到BED,GFF3或GTF格式的DNA序列中。
9.从UniProt导入
可以从UniProt数据库导入蛋白质序列记录。
10.进口基因组编译器项目
现在可以在SnapGene中直接打开Genome Compiler项目文件(.gcproj)。对于施工项目文件,在“历史记录”视图中捕获施工历史。
11.引物添加日期
将引物添加到文件时,会记录日期。引物可按添加日期排序。
12.读取和写入对齐文件格式
SnapGene可以将对齐导入SAM / BAM和VectorNTI?.cep格式的参考序列,并可以将对齐导出为SAM / BAM格式的参考序列。
SnapGene安装教程(附破解教程)
1.将3D软件提供的文件解压,首先点击EXE文件开始安装
2.安装路径可以直接默认或者是安装在非中文路径中
3.接下来点击i agree即可
4.勾选需要的扩展功能,点击next进行下一步
5.接下来直接点击install开始安装
6.等待片刻即可安装成功,取消勾选运行程序,点击finish完成安装
7.将3D软件提供的文件中crack中的SnapGene.exe复制至程序的安装目录即可
snapgene怎么比对序列
1.打开snapgene软件 -> 点击“新DNA”
2.将需要比对的DNA序列或者参考基因序列复制到框内 -> 选择线性还是环状 -> 编辑文件名称(方便保存以后直接打开查看)-> 点击“可以”
3.继续点击左边窗口的“显示比对”出现比对窗口 -> 点击下面的“序列”查看序列比对信息 -> 点击“比对的序列”或者鼠标右键选择输入或者复制需要比对的序列
4.输入比对序列,选择测序数据还可以点击如图三角符号查看数据碱基峰值情况(前提是输入的序列文件是测序结果的)
此次比较的是参考DNA和包含克隆SNP位点的序列,可以观察到SNP杂合位点的双峰情况,最后验证生信分析结果的准确性
网友 元气少女李逵 评论:
使用感受:应该是近些年来比较优异的几款工具了,估计以后也很难会被超越了,丰富而具有特色的功能,太强了,抢到令人发指